Мультфильм "Мегамозг против Синдиката Рока" продолжает историю бывшего суперзлодея Мегамозга, который теперь яростно защищает Метро-Сити. Его жизнь обретает новое направление, когда в город возвращаются прежние приспешники — Синдикат Рока, решившие восстановить свои злодейские амбиции. Мегамозг, вместо того чтобы вернуться на кривую дорожку, принимает вызов и вступает в борьбу с давними соратниками. В поисках поддержки он объединяется с давними друзьями и новыми союзниками, чтобы противостоять угрозе. Используя свою гениальность и изобретательность, он разрабатывает хитроумные планы, чтобы помешать преступным замыслам Синдиката. В этой динамичной битве Мегамозг сталкивается не только с внешними врагами, но и с внутренними сомнениями, доказывая себе и окружающим, что добро всегда сильнее зла.